Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBA6A0AVT1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBA6A0AVT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBA6A0AVT1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBA6A0AVT1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms