Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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