Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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