Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM2AQ9Y2K7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms