Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11BQ9Y2G3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11BQ9Y2G3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11BQ9Y2G3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11BQ9Y2G3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11BQ9Y2G3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms