Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DTX4Q9Y2E6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms