Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS5Q9UPZ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms