Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC4AQ9UMR7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms