Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD4Q9ULV1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms