Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C4Q9UKN8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C4Q9UKN8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms