Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2D1Q9UJQ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms