Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPN3Q9UHW5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms