Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED13Q9UHV7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED13Q9UHV7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms