Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms