Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNK4Q9NYG8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms