Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM53CQ9NYF3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms