Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms