Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms