Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP3Q9NS15 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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