Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GLB2Q9NR46 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GLB2Q9NR46 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms