Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH3-202ENST00000524742 842 ntTSL 215.84■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-206ENST00000518394 720 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-207ENST00000530043 632 ntTSL 315.76■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH3-212ENST00000534171 764 ntTSL 515.76■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYP26A1-203ENST00000622925 768 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DHX37-203ENST00000539298 4550 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPB-209ENST00000634889 507 ntTSL 315.72■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SERPINB1-204ENST00000476896 872 ntTSL 515.7■□□□□ 0.19e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UTP4-213ENST00000568448 562 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-204ENST00000525127 750 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-206ENST00000590088 3131 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CORO6-204ENST00000467534 3502 ntTSL 515.64■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MSANTD4-204ENST00000530788 948 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPP2R2D-203ENST00000472664 770 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH3-207ENST00000530803 1557 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-205ENST00000562519 1790 ntTSL 215.3■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KANK2-204ENST00000588787 2952 ntTSL 515.3■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-211ENST00000579877 561 ntTSL 215.25■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-216ENST00000639335 1327 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 EVI5-202ENST00000466778 321 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 215.18■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DHX37-204ENST00000542400 3065 ntTSL 215.08■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 09e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN5A-215ENST00000592509 589 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -08e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-209ENST00000534617 905 ntTSL 214.97□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD12-208ENST00000491682 814 ntTSL 314.96□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.029e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PTS-209ENST00000531673 986 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-204ENST00000460968 842 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CORO6-203ENST00000459686 4069 ntTSL 514.87□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-207ENST00000472518 1105 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-221ENST00000640201 1972 ntTSL 514.74□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-211ENST00000638559 1369 ntTSL 514.73□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-26■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC27-204ENST00000468750 463 ntTSL 314.65□□□□□ -0.066e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-223ENST00000640752 5948 ntTSL 514.58□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAP3K6-206ENST00000486046 444 ntTSL 314.48□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WWOX-206ENST00000561846 769 ntTSL 314.45□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITIH5-203ENST00000434980 2651 ntTSL 214.4□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-206ENST00000434732 253 ntTSL 214.39□□□□□ -0.116e-13■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BIN2-205ENST00000604560 2003 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-219ENST00000588569 875 ntTSL 314.29□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-205ENST00000587869 568 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CHID1-214ENST00000528534 321 ntTSL 314.26□□□□□ -0.136e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 STK10-202ENST00000517360 2184 ntTSL 214.17□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.158e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC38A5-206ENST00000480105 894 ntTSL 213.81□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-204ENST00000418794 640 ntTSL 513.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-204ENST00000469824 512 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-206ENST00000529544 447 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-210ENST00000520794 2958 ntTSL 213.65□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 223.6
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