Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLCO1B3Q9NPD5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms