Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms