Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX8Q9HC52 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms