Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LY9Q9HBG7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms