Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms