Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP6Q9GZR1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms