Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP39Q9C0H5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP39Q9C0H5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms