Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms