Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms