Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF4Q9BUZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms