Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF4Q9BRK5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms