Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms