Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms