Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPSNAP1Q9BPW8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP1Q9BPW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms