Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID3AQ99856 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms