Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms