Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF12Q96QT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms