Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms