Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms