Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC7Q96M83 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms