Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms