Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAMP1Q96JM3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms