Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms