Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms