Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELP4Q96EB1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELP4Q96EB1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms