Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL4Q96C24 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms