Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms