Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC74AQ96AQ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CCDC74AQ96AQ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CCDC74AQ96AQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC74AQ96AQ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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