Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYAP1Q96A49 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms